Length polymorphisms in mtDNA of each individual.

Numbers refer to the nucleotide numbers of the revised Cambridge reference sequence (rCRS). 
Individual Hypervariable region 1
(303-317)
CA repeat
(514-523)

C stretch 1
(568-573)

12S rRNA
(956-965)

C stretch 2
(5895-5899)

9-bp deletion/insertion
(8272-8289)

Hypervariable region 2
(16180-16195)

rCRS CCCCCCCTCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0001 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0002 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0005 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCCCCCCAT
ONsq0009 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCAT
ONsq0010 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCCCCCCAT
ONsq0011 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0012 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCTCTCCCCAT
ONsq0013 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0014 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0015 CCCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0016 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCTCTCCCCAT
ONsq0017 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0019 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0022 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0023 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0025 CCCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AAAACCCTCCCCCCAT
ONsq0027 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACTCCCTCCCCAT
ONsq0028 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCCCCCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0029 CCCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCCCCCCCAT
ONsq0032 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCAT
ONsq0033 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0034 CCCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0035 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0036 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0037 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0038 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCTCCCCCCAT
ONsq0039 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0040 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0041 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0042 CCCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCCC
ONsq0043 CCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0046 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCCCCCCCAT
ONsq0047 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCCCCCCGT
ONsq0049 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0050 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0052 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCCCCCCAT
ONsq0053 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCCCCCCGC
ONsq0055 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0059 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0060 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCTCTCCCCAT
ONsq0062 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCT CCCCCTCTACCCCCTCTA AACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0063 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCTCAT
ONsq0065 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0066 CCCCCCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0067 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCTCTCCCCAT
ONsq0068 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0069 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0070 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0072 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0074 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCAT
ONsq0079 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0081 CCCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0082 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0083 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCCCCCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0084 CCCCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0086 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCCTCCCC CCCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0087 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCCCCCCGC
ONsq0089 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCAT
ONsq0091 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0092 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCTCTCCCCAT
ONsq0093 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0095 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0096 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0097 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCCCCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0098 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0100 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0102 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0104 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0105 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAACCCCCCTCCCCAT
ONsq0106 CCCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCTCTCCCCAT
ONsq0110 CCCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0111 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0112 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0114 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0115 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0119 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0120 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0121 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0122 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCCCCCCGC
ONsq0123 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0125 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0127 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAATCCCCTCCCCAT
ONsq0128 CCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0130 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAACCCCTCCCCCAT
ONsq0134 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCCCCCCAT
ONsq0135 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCTCTCCCCAT
ONsq0136 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCTCCCCCAT
ONsq0138 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0140 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCCCCCCAT
ONsq0141 CCCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AACCCCCCCCCCCCCAT
ONsq0142 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0143 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0144 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0148 CCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCCCCCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT
ONsq0150 CCCCCCCCCTCCCCCCGC CACACACA CCCCCC CCCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTA AAACCCCCCCCCCCCAT
ONsq0151 CCCCCCCTCCCCCCGC CACACACACA CCCCCC CCCCCTCCCC CCCCC CCCCCTCTACCCCCTCTA AAAACCCCCTCCCCAT